EncFS este un sistem de fișiere criptografic gratuit (LGPL) bazat pe FUSE. Acesta criptează în mod transparent fișierele, folosind un director arbitrar ca stocare pentru fișierele criptate. Două directoare sunt implicate în montarea unui sistem de fișiere EncFS: directorul sursă și punctul de montare. Fiecare fișier din punctul de montare are un fișier specific în directorul sursă care îi corespunde. Fișierul din punctul de montare oferă vizualizarea necriptată a celui din directorul sursă. Numele fișierelor sunt criptate în directorul sursă. Fișierele sunt criptate folosind o cheie de volum, care este stocată fie în interiorul, fie în afara directorului sursă criptat. O parolă este folosită pentru a decripta această cheie.